Me encanta markdown. Tiene una sintaxis fácil de aprender y convive muy bien con texto existente en HTML. Es un buen lenguaje para foros o blogs, ya que permite dar formato de forma sencilla sin necesidad de saber HTML.
Recientemente quería usar markdown para un proyecto que estoy haciendo con Rails. El framework ofrece un método para trabajar directamente con markdown, pero es necesario tener instalada una librería externa a Rails. En mi caso opté por BlueCloth.